2012年，工業和信息化部對2011年淘汰落后產能工作進行了檢查考核，瑤燕造紙廠屬已關停但未徹底拆除的企業。工業和信息化部、國家能源局要求，須防止已關停但未拆除企業恢復生產。
　　
　　2013年3月13日，南口鎮常務副鎮長黃文輝告訴記者，2011年瑤燕造紙廠被叫停后，當地村民對該廠的舉報卻并沒有減少，“鎮里也被這個廠搞得很頭疼。”
　　
　　梅縣環保局副局長鐘志文表示，瑤燕造紙廠的排污許可證已經于2012年6月到期，2011年該廠被列入淘汰落后產能企業名單之后，有關部門也沒有對其進行年審或者換證。
　　
　　梅縣工商局提供的材料則顯示，瑤燕造紙廠目前屬于無證生產廢紙紙漿。
　　
　　鐘志文說，瑤燕造紙廠被列入淘汰落后產能企業名單，主要是因為該廠生產技術落后，同時也是為了完成當年梅縣主要污染物總量排放控制任務和實現縣級黨政領導班子環境保護責任考核達標，“但沒有想到，關停會這么難。”
　　
　　根據梅縣環保局提供的材料，2011年底以來，至少有梅縣、南口鎮兩級政府，梅縣環保局、經濟和信息化局、工商局、質量技術監督局、信訪局、監察局、紀委以及梅州市淘汰落后產能工作聯席會議辦公室八個職能部門，介入對瑤燕造紙廠問題的處理中，但始終未能將該廠徹底關閉。
　　
　　鐘志文稱，環保部門能做的主要是檢查排污情況，通知相關部門共同處理排污企業，沒有強制關停瑤燕造紙廠的權力，“主管淘汰落后產能企業的是經濟和信息化局，將瑤燕造紙廠已停產情況上報工業和信息化部的也是他們。”
　　
　　梅縣經濟和信息化局黨組書記熊浩明告訴記者，2011年瑤燕造紙廠的停產情況確實是由該局上報的，“縣里有減排目標和任務，雖然瑤燕造紙廠一時無法關停，也只能先按‘已經完成'上報了。”
　　
　　停產期限一拖再拖
　　
　　對于瑤燕造紙廠遲遲未能關停的原因，南口鎮黨委委員曹志豪介紹，瑤燕造紙廠是1991年由30余戶村民集資100余萬元創辦的，屬于村辦集體企業，“鎮里不敢強行關閉，怕集資村民鬧事。”曹志豪說，“如果關停了廠子，集資村民就會要求賠償，鎮里拿不出這筆錢。”